ศูนย์จีโนม เผย ต้นปีหน้าแต่ละภูมิภาคอาจเกิดการระบาดรอบใหม่จาก 'ซุปโอไมครอนสายพันธุ์ย่อย'

          ศูนย์จีโนมทางการแพทย์ คณะแพทย์ศาสตร์ โรงพยาบาลรามาธิบดี โพสต์ข้อความผ่านเพจเฟซบุ๊ก Center for Medical Genomics ระบุเรื่อง ซุปโอไมครอนสายพันธุ์ย่อย (A soup of omicron subvariants) อาจก่อให้เกิดการระบาดระลอกใหม่ (new wave) ในแต่ละภูมิภาคด้วยสายพันธุ์ย่อยที่แตกต่างกัน

          การระบาดของโอไมครอนมีความหลากหลายในรูปแบบของการหมุนเวียนอยู่ในประชากรของโลก ซึ่งทำให้คาดเดาแนวโน้มการระบาดในอนาคตได้ยากขึ้น ดังนั้นผู้เชี่ยวชาญทั่วโลกจึงได้เปรียบการระบาดของโควิดในช่วงปีที่ 3 เสมือน ซุปโอไมครอนสายพันธุ์ย่อย (A soup of omicron subvariants)

          วลีเด่นช่วงนี้คือ 'ซุปโอไมครอน' เรียกขานโดยกลุ่มผู้เชี่ยวชาญโควิด-19 ทั่วโลก ชี้ให้เห็นถึงความแตกต่างของธรรมชาติของการกลายพันธุ์ของไวรัสโคโรนา 2019 ที่เปลี่ยนไป

          การดำเนินการถอดรหัสพันธุกรรมทั้งจีโนมของไวรัสโคโรนา 2019 และจัดเก็บในฐานข้อมูลโควิดโลก “GISAID” จากผู้ติดเชื้อทั่วโลกตลอด 3 ปี จำนวนกว่า 13.7 ล้านตัวอย่าง (วันที่ 1 พ.ย. 65) นำมาประมวลผลด้วยคอมพิวเตอร์สมรรถนะสูงสร้างเป็นต้นไม้แห่งการวิวัฒนาการ (phylogenetic tree) เพื่อดูความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างตระกูลของโคโรนา 2019 (-2022) พบว่า ในช่วง 2 ปีแรกตระกูลใหญ่ของโคโรนาไวรัสซึ่งมีรหัสพันธุกรรมแตกต่างกันอย่างมากได้เกิดขึ้นและถูกแทนที่ด้วยตระกูลใหญ่ถัดไปอย่างต่อเนื่อง ตั้งแต่ตระกูลไวรัสอู่ฮั่น ได้ถูกแทนที่ด้วยตระกูล อัลฟา, เบตา, แกมมา, เดลตา และ โอไมครอน ตามลำดับ และเนื่องจากส่วนหนามแหลมของแต่ละตระกูลมีการกลายพันธุ์เปลี่ยนแปลงแตกต่างกันอย่างมากทำให้ระบบภูมิคุ้มกันของร่างกายเราพัฒนาตามไม่ทัน เข้าไปจับทำลายไวรัสไม่ได้ ทำให้มีผู้ติดเชื้อเจ็บป่วย รุนแรง และเสียชีวิตเป็นจำนวนมาก โดยเฉพาะในช่วงการระบาดของตระกูลเดลตา

          แต่เมื่อการระบาดย่างเข้าสู่ช่วงปีที่ 3 ในยุคของตระกูลโอไมครอนกลับมีวิวัฒนาการเกิดเป็นสายพันธุ์ย่อยมากกว่า 300 สายพันธุ์ (omicron subvariants) โดยแต่ละสายพันธุ์ย่อยของโอไมครอนมีการกลายพันธุ์ต่างไปจากไวรัสโคโรนา 2019 สายพันธุ์ดั้งเดิม “อู่ฮั่น” มากกว่า 100 ตำแหน่ง โดยเฉพาะส่วนหนามที่อยู่ในส่วนเปลือกนอกห่อหุ้มอนุภาคไวรัสไว้

          ส่วนหนามมีบทบาทสำคัญในการหลบเลี่ยงภูมิคุ้มกันจากวัคซีนและจากภูมิคุ้มกันที่เราได้รับจากการติดเชื้อโควิดตามธรรมชาติ และเป็นที่น่าสนใจมากว่าส่วนหนามของโอไมครอนแต่ละสายพันธุ์ย่อยมีทั้งที่ซ้ำกับสายพันธุ์โอไมครอนดั้งเดิมประหนึ่งเป็นการรีไซเคิล (recycle) นำตำแหน่งการกลายพันธุ์ดั้งเดิมที่ใช้ได้ผล (ในการหลบเลี่ยงภูมิ) กลับมาใช้ใหม่ผสมผสานกับการกลายพันธุ์ตำแหน่งใหม่ซึ่งจำเป็นเพื่อแข่งขันกันเองเพื่อการอยู่รอดในหมู่ของโอไมครอนสายพันธุ์ย่อย

          สรุปได้ว่า ซุปโอไมครอนสายพันธุ์ย่อย (A soup of omicron subvariants) ประกอบด้วย หลายหลายสายพันธุ์ย่อยพร้อมกันเหมือนซุป เช่น BA.2.75, BA.2.75.2,BQ.1, BQ.1.1, BF.7, XBB, XBB.1,XBB.2, XBB.3,XBB.4, และ XBB.5 มีแข่งขันกันเพื่อความอยู่รอด และเนื่องจากแต่ละสายพันธุ์ย่อยมีการรีไซเคิลตำแหน่งการกลายพันธุ์ของโอไมครอนดั้งเดิม เช่นในตำแหน่ง “R346, L452, K444, F486, N460” อันอาจเป็นปัจจัยสำคัญทำให้ระบบภูมิคุ้มกันของเรารู้จักคุ้นเคยมากก่อนล่วงหน้า สังเกตได้ว่าการติดเชื้อเจ็บป่วยจากโอไมครอนสายพันธุ์ต่างๆไม่ว่าจะเป็น BA.1,BA.2,BA.4,BA.5 และล่าสุด BQ.1 และ XBB จึงมีอาการที่ไม่แตกต่างกัน คือไม่รุนแรงต้องรักษาตัวใน รพ. รวมทั้งมีจำนวนผู้เสียชีวิตน้อยกว่าเมื่อเทียบกับสายพันธุ์เดลตา

         ในช่วงเข้าสู่ฤดูหนาวปลายปีนี้และต้นปีหน้า คาดว่าแต่ละภูมิภาคจะมีการติดเชื้อโอไมครอนสายพันธุ์ย่อยที่แตกต่างกัน เช่น

-ในทวีปยุโรปและอเมริกา มีการติดเชื้อโอไมครอน BQ.1 และ BQ.1.1

-ขณะที่ ทวีปเอเชีย โดยเฉพาะ อินเดีย บังกลาเทศ มาเลเซียและสิงคโปร์ พบการระบาดของ XBB,XBB.1-XBB.5

-ทวีปออสเตรีย พบการระบาดผสมผสานระหว่าง BQ.1* และ XBB*

*ในประเทศไทย ยังคงพบโอไมครอนสาย BA.5* ถึงร้อยละ 97.83%

*ส่วนสายพันธุ์ย่อย

-BA.4.6 จำนวน 2 ราย

-BQ.1.1 ไม่พบ

-BQ.1 จำนวน 1 ราย

-BF.7 จำนวน 2 ราย

-BA.2.75 จำนวน 24 ราย

-BA.2.75.2 จำนวน 6 ราย

-XBB ไม่พบ

          สำหรับช่วงหน้าหนาวในประเทศไทยซึ่งคาดกันว่าจะระยะเวลายาวนานซึ่งจะทำให้อนุภาคไวรัสคงอยู่ในสิ่งแวดล้อมได้นานขึ้นอาจส่งเสริมให้มีการระบาดระลอกใหม่หรือไม่และเป็นโอไมครอนสายพันธุ์ย่อยใดนั้นยังตอบได้ แต่หน่วยงานที่เกี่ยวข้องของประเทศรวมทั้งศูนย์จีโนมทางการแพทย์ รพ. รามาธิบดี กำลังเฝ้าติดตามโดยการถอดรหัสพันธุกรรม (sequencing) ทั้งจีโนมหรือบางส่วน (genotyping) ซึ่งขณะนี้จำนวนการสุ่มถอดรหัสพันธุกรรมในประเทศไทยลดลงอย่างมากเพราะจำนวนผู้ติดเชื้อโคโรนา 2019 ในประเทศลดลงอย่างต่อเนื่อง ตัวอย่างที่ส่งมาตรวจที่ห้องปฏิบัติการไวรัสวิทยา รพ. รามาธิบดี ช่วงนี้ลดเหลือเพียง 4-12 ตัวอย่างต่อวัน และตรวจพบ PCR เป็นบวกเพียงวันรายเดียวเท่านั้น

ปล. ข้อมูลจาก GISAID วันที่ 1/11/2565 https://gisaid.org/

#โควิด19

#ซุปโอไมครอนสายพันธุ์ย่อย

CR:ข้อมูล-ภาพ Center for Medical Genomics